MAGI’S LAB S.r.l.

Sede di lavoro: San Felice del Benaco (Brescia)

Settore: Genetica medica, genomica, bioinformatica, diagnostica molecolare e scienze omiche

Tipologia di impiego: Full-time – Contratto e retribuzione commisurati all'esperienza e alle competenze professionali

Chi siamo

MAGI’S LAB S.r.l., società del Gruppo MAGI, attiva nella diagnostica genetica, nella ricerca biomedica e nello sviluppo di tecnologie bioinformatiche applicate alla medicina, ricerca un/una Bioinformatico/a Senior (Senior Bioinformatician) da inserire nel proprio team presso la sede di San Felice del Benaco (BS).

La figura selezionata avrà un ruolo di riferimento tecnico e scientifico nella progettazione, nello sviluppo, nell'ottimizzazione e nel coordinamento delle piattaforme bioinformatiche aziendali, contribuendo all'integrazione di metodologie computazionali avanzate nei processi diagnostici e nei progetti di ricerca.

Il/la candidato/a collaborerà direttamente con genetisti, biologi molecolari, ricercatori, sviluppatori software e specialisti IT, contribuendo alla definizione delle strategie tecnologiche e all'evoluzione dell'infrastruttura bioinformatica del Gruppo.

Principali attività e responsabilità

- Analisi genomica avanzata e NGS: progettazione, sviluppo, validazione e ottimizzazione di pipeline per dati WES, WGS e pannelli genetici, con particolare riferimento all'identificazione di SNV, indel, CNV e varianti strutturali.
- Interpretazione computazionale delle varianti genetiche: sviluppo e integrazione di sistemi di annotazione, filtraggio, prioritizzazione e classificazione delle varianti, secondo le raccomandazioni ACMG/AMP e ClinGen.
- Architettura e sviluppo delle piattaforme bioinformatiche: progettazione e coordinamento dello sviluppo di software, database, API, strumenti di analisi e workflow automatizzati per applicazioni diagnostiche e di ricerca.
- High-Performance Computing e parallelizzazione: ottimizzazione delle prestazioni computazionali, gestione efficiente di grandi volumi di dati genomici, implementazione di sistemi di calcolo parallelo e distribuito, con possibile utilizzo di accelerazione GPU.
- Integrazione multi-omica: sviluppo di metodologie e pipeline per l'elaborazione e l'integrazione di dati genomici, trascrittomici, metagenomici, metabolomici e proteomici.
- Intelligenza artificiale e machine learning: implementazione e valutazione di algoritmi computazionali per l'analisi di dati biologici complessi, la prioritizzazione delle varianti e l'identificazione di biomarcatori.
- Automazione e gestione dei dati: sviluppo di sistemi riproducibili, scalabili e tracciabili, con particolare attenzione al controllo di qualità, alla sicurezza, alla protezione dei dati e alla gestione delle versioni software.
- Coordinamento tecnico e scientifico:



supervisione delle attività bioinformatiche, definizione delle priorità di sviluppo, supporto ai collaboratori e interazione con i responsabili scientifici e informatici.
- Ricerca e innovazione: partecipazione a progetti scientifici nazionali e internazionali, sviluppo di nuove metodologie computazionali e contributo alla preparazione di pubblicazioni scientifiche.

Requisiti richiesti
- Laurea magistrale in Bioinformatica, Informatica, Biotecnologie, Biologia Computazionale, Ingegneria Informatica o discipline affini. Dottorato di ricerca considerato un titolo preferenziale.
- Esperienza professionale significativa, indicativamente di almeno 5 anni, nello sviluppo e nell'applicazione di metodologie bioinformatiche, preferibilmente in ambito di genetica medica o diagnostica.
- Eccellente conoscenza di Python, degli ambienti Linux e degli strumenti di programmazione e scripting.
- Esperienza consolidata nella progettazione, nello sviluppo, nella validazione e nella manutenzione di pipeline NGS.
- Conoscenza approfondita dei principali formati genomici (FASTQ, BAM/CRAM, VCF) e delle metodologie di analisi delle varianti.
- Esperienza con strumenti bioinformatici quali BWA, GATK, SAMtools, bcftools, VEP o equivalenti.
- Familiarità con database genomici e clinici quali ClinVar, gnomAD e OMIM.
- Conoscenza delle linee guida ACMG/AMP e dei principali criteri di classificazione delle varianti genetiche.
- Capacità di progettare soluzioni software strutturate, scalabili, documentate e riproducibili.
- Esperienza con Git, Docker e sistemi di gestione dei workflow quali Nextflow o Snakemake.
- Capacità di affrontare autonomamente problematiche computazionali complesse e di coordinare attività tecniche multidisciplinari.
- Buona conoscenza della lingua inglese scientifica e tecnica.

Competenze preferenziali

- Esperienza nella gestione e nell'ottimizzazione di infrastrutture HPC (High-Performance Computing), sistemi di calcolo distribuito e strumenti di parallelizzazione.
- Conoscenza di tecnologie di accelerazione GPU, programmazione CUDA o framework per il calcolo scientifico ad alte prestazioni.
- Esperienza nell'analisi metagenomica e del microbioma, nell'elaborazione di dati di sequenziamento e nello sviluppo di pipeline multi-omiche.
- Competenze in machine learning, deep learning e intelligenza artificiale applicati alla biologia computazionale.




- Esperienza con database SQL e NoSQL, sviluppo back-end e front-end, API REST e architetture software modulari.
- Familiarità con sistemi di orchestrazione, ambienti cloud, containerizzazione e strumenti per la gestione di risorse computazionali.
- Conoscenza di strumenti di gestione dei carichi HPC, quali SLURM, e di tecniche di profiling e ottimizzazione delle prestazioni.
- Esperienza nella validazione di pipeline bioinformatiche in contesti di diagnostica molecolare e laboratori accreditati.
- Conoscenza delle buone pratiche di sicurezza informatica e degli standard ISO/IEC 27001, ISO/IEC 27701 e ISO 15189.
- Esperienza nel coordinamento di gruppi di sviluppo bioinformatico, nella gestione di progetti software e nel mentoring di collaboratori junior.
- Pubblicazioni scientifiche in ambito bioinformatico, genomico o computazionale.

Cosa offriamo
- Inserimento in un gruppo multidisciplinare con attività consolidate nella diagnostica genetica, nella ricerca biomedica e nelle scienze omiche.
- Ruolo senior con responsabilità tecniche e scientifiche, autonomia progettuale e possibilità di contribuire direttamente all'evoluzione delle piattaforme bioinformatiche aziendali.
- Partecipazione allo sviluppo di infrastrutture computazionali e software destinati ad applicazioni concrete nella diagnostica molecolare.
- Occasione di collaborare a progetti di ricerca con università e istituzioni scientifiche nazionali e internazionali.
- Possibilità di sviluppare metodologie innovative nell'ambito della genomica, della bioinformatica multi-omica e dell'intelligenza artificiale.
- Partecipazione alla preparazione di pubblicazioni scientifiche e a progetti di ricerca interdisciplinari.
- Formazione specialistica e aggiornamento professionale continuo.
- Retribuzione e inquadramento contrattuale definiti sulla base delle competenze, dell'esperienza e delle responsabilità assegnate.

Profilo ricercato

Cerchiamo un professionista senior, con solide competenze sia bioinformatiche sia informatiche, capace non soltanto di utilizzare gli strumenti di analisi esistenti, ma soprattutto di progettare, sviluppare, integrare e migliorare autonomamente sistemi computazionali complessi.

Il candidato ideale dovrà dimostrare capacità di visione architetturale, autonomia nella risoluzione di problematiche tecniche, attitudine al coordinamento dei progetti e interesse per l'applicazione delle più moderne tecnologie computazionali alla genetica medica.

Saranno particolarmente apprezzate le candidature di professionisti che abbiano già contribuito allo sviluppo di piattaforme bioinformatiche integrate e che siano in grado di assumere progressivamente un ruolo di responsabilità nel coordinamento dell'area bioinformatica aziendale.

📌 Bioinformatico Senior (San felice del Benaco)
🏢 Magi S Lab
📍 San felice del Benaco